Différences

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:jalview_21141 [2024/07/11 16:01] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:jalview_21141 [2025/05/15 15:10] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
Ligne 1: Ligne 1:
-====== Installation de JalView 2.11.3.======+====== Installation de JalView 2.11.4.======
  
 ===== Librairies additionnelles ===== ===== Librairies additionnelles =====
Ligne 13: Ligne 13:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo mkdir ./jalview-all-2.11.3.3-j1.8 && cd ./jalview-all-2.11.3.3-j1.8 +% sudo mkdir ./jalview-all-2.11.4.1-j1.8 && cd ./jalview-all-2.11.4.1-j1.8 
-% sudo curl -L -O https://www.jalview.org/downloads/jar/release/jalview-all-2.11.3.3-j1.8.jar +% sudo curl -L -O https://www.jalview.org/downloads/jar/release/jalview-all-2.11.4.1-j1.8.jar 
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 20: Ligne 20:
  
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.3.3-j1.8 +% sudo chown -R root:root /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.4.1-j1.8 
-% sudo chmod 755 /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.3.3-j1.8+% sudo chmod 755 /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.4.1-j1.8
 </sxh> </sxh>
    
Ligne 27: Ligne 27:
 <sxh bash> <sxh bash>
 #!/bin/sh #!/bin/sh
-java -jar /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.3.3-j1.8/jalview-all-2.11.3.3-j1.8.jar+java -jar /opt/bio/sources/jalview-all-2.11.4.1-j1.8/jalview-all-2.11.4.1-j1.8.jar
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 40: Ligne 40:
 # Jalview specific environment variables # Jalview specific environment variables
 # #
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jalview-all-2.11.3.3-j1.8+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jalview-all-2.11.4.1-j1.8
 </sxh> </sxh>
  
   * Pour ajouter Jalview dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:   * Pour ajouter Jalview dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
     * Plus à venir...     * Plus à venir...