Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:hisat2_221 [2025/08/20 09:27] – [Procédure] foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:hisat2_221 [2026/02/11 11:11] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
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 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo curl -L -o hisat2-2.2.1.zip https://cloud.biohpc.swmed.edu/index.php/s/hisat2-221-source/download +% sudo curl -L -o hisat2-2.2.1.tar.gz https://github.com/DaehwanKimLab/hisat2/archive/refs/tags/v2.2.1.tar.gz 
-% sudo unzip hisat2-2.2.1.zip +% sudo unzip hisat2-2.2.1.tar.gz 
-% sudo rm hisat2-2.2.1.zip+% sudo rm hisat2-2.2.1.tar.gz
 </sxh> </sxh>
  
-  * Vous devez ensuite copier le répertoire ''patches'' du dossier ''debian'' qui se trouve dans votre répertoire:+  * Si vous compilez sur ARM64, vous devez ensuite copier le répertoire ''patches'' du dossier ''debian'' qui se trouve dans votre répertoire:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % sudo cp -r ~/debian/patches ./hisat2-2.2.1 % sudo cp -r ~/debian/patches ./hisat2-2.2.1
 </sxh> </sxh>
  
-  * Vous devez corriger les fichiers nécessaires en utilisant les informations contenues dans le dossier ''patches'':+  * Si vous compilez sur ARM64, vous devez corriger les fichiers nécessaires en utilisant les informations contenues dans le dossier ''patches'':
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd hisat2-2.2.1 % cd hisat2-2.2.1
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   * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.   * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
- 
 <sxh bash> <sxh bash>
 % sudo chown -R root:root ../hisat2-2.2.1 % sudo chown -R root:root ../hisat2-2.2.1
Ligne 48: Ligne 47:
  
   * La compilation se fait simplement:   * La compilation se fait simplement:
- 
 <sxh bash> <sxh bash>
 % sudo make % sudo make