Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:hisat2_221 [2025/08/20 09:18] – [Librairies additionnelles] foisys
+++ fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:hisat2_221 [2025/08/20 09:27] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
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 Voici la procédure suivi pour l'installation de Bowtie2 à partir du code source:
+  * Il faut télécharger un package disponible sur le site ''packages.ubuntu.com'' pour obtenir les //patches// logicielles pour une compilation dans une architecture ARM64 (l'application de ses patches n'affectera pas la compilation dans un environnement x86_64):
+<sxh bash>
+# Dans votre compte:
+% curl -L -O http://archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/h/hisat2/hisat2_2.2.1-4.debian.tar.xz
+% tar -xf hisat2_2.2.1-4.debian.tar.xz
+# Et vous devriez voir un répertoire appelé Debian :-)
+</sxh>
   * Sous ''/opt/bio/sources'', l'archive du code source a été téléchargé du site web et décompressé.
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 % sudo unzip hisat2-2.2.1.zip
 % sudo rm hisat2-2.2.1.zip
+</sxh>
+  * Vous devez ensuite copier le répertoire ''patches'' du dossier ''debian'' qui se trouve dans votre répertoire:
+<sxh bash>
+% sudo cp -r ~/debian/patches ./hisat2-2.2.1
+</sxh>
+  * Vous devez corriger les fichiers nécessaires en utilisant les informations contenues dans le dossier ''patches'':
+<sxh bash>
+% cd hisat2-2.2.1
+% sudo quilt push -a
 </sxh>
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 <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./hisat2-2.2.1
+% sudo chown -R root:root ../hisat2-2.2.1
-% sudo chmod 755 ./hisat2-2.2.1
+% sudo chmod 755 ../hisat2-2.2.1
 </sxh>
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 <sxh bash>
-% cd hisat2-2.2.1
 % sudo make
 </sxh>