Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:artemis_1820 [2025/05/15 14:43] – créée foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:artemis_1820 [2025/05/15 14:44] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
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   * Il faut télécharger l'archive du site web et la décompresser sous ''/opt/bio/sources''. Vous trouverez un dossier nommé ''artemis''.   * Il faut télécharger l'archive du site web et la décompresser sous ''/opt/bio/sources''. Vous trouverez un dossier nommé ''artemis''.
  
-<sxh bash> % cd /opt/bio/sources % sudo curl -L -O [[https://github.com/sanger-pathogens/Artemis/releases/download/v18.2.0/artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz|https://github.com/sanger-pathogens/Artemis/releases/download/v18.2.0/artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz]] % sudo tar -zxvf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz % sudo rm -rf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz </sxh>+<sxh bash>  
 +% cd /opt/bio/sources  
 +% sudo curl -L -O https://github.com/sanger-pathogens/Artemis/releases/download/v18.2.0/artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz 
 +% sudo tar -zxvf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz  
 +% sudo rm -rf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz  
 +</sxh>
  
   * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.   * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
  
-<sxh bash> % sudo chown -R root:root ./artemis % sudo chmod 755 ./artemis </sxh>+<sxh bash>  
 +% sudo chown -R root:root ./artemis  
 +% sudo chmod 755 ./artemis  
 +</sxh>
  
   * Il reste à rendre les outils d'Artemis disponible pour tous en éditant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  en y ajoutant à la toute fin les lignes suivantes:   * Il reste à rendre les outils d'Artemis disponible pour tous en éditant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  en y ajoutant à la toute fin les lignes suivantes:
  
-<sxh bash> # # Artemis specific environment variables # export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/artemis </sxh>+<sxh bash>  
 + 
 +# Artemis specific environment variables  
 + 
 +export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/artemis </sxh>
  
   * Artemis devient accessible simplement avec la commande suivante:   * Artemis devient accessible simplement avec la commande suivante:
  
-<sxh bash> % art </sxh>+<sxh bash>  
 +% art  
 +</sxh>
  
   * Pour ajouter les outils d'Artemis dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:   * Pour ajouter les outils d'Artemis dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
       * Plus à venir…       * Plus à venir…