Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a24_build:spades_400 [2024/11/22 09:42] – créée foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a24_build:spades_400 [2024/11/22 09:44] (Version actuelle) – [Procédure d'installation] foisys
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 </sxh> </sxh>
  
-  * Deuxièmement, le répertoire ''SPAdes-4.0.0''  doit appartenir à ''root''  et ses permissions doivent être ''755'':+  * Deuxièmement, le répertoire ''spades-4.0.0''  doit appartenir à ''root''  et ses permissions doivent être ''755'':
  
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./SPAdes-4.0.0 +% sudo chown -R root:root ./spades-4.0.0 
-% sudo chmod 755 ./SPAdes-4.0.0+% sudo chmod 755 ./spades-4.0.0
 </sxh> </sxh>
  
   * Les développeurs ont inclus un script de compilation qui s'occupe de tout:   * Les développeurs ont inclus un script de compilation qui s'occupe de tout:
 <sxh bash> <sxh bash>
-% cd ./SPAdes-4.0.0+% cd ./spades-4.0.0
 % sudo ./spades_compile.sh % sudo ./spades_compile.sh
 </sxh> </sxh>
Ligne 43: Ligne 43:
 % cd % cd
 # Exécutez le test interne de SPAdes # Exécutez le test interne de SPAdes
-% /opt/bio/sources/SPAdes-4.0.0/bin/spades.py --test+% /opt/bio/sources/spades-4.0.0/bin/spades.py --test
 </sxh> </sxh>
  
   * Pour simplifier notre existence:   * Pour simplifier notre existence:
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo ln -s /opt/bio/sources/SPAdes-4.0.0/bin/spades.py /opt/bio/sources/SPAdes-4.0.0/bin/spades+% sudo ln -s /opt/bio/sources/spades-4.0.0/bin/spades.py /opt/bio/sources/spades-4.0.0/bin/spades
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 57: Ligne 57:
 # SPAdes specific environment variable # SPAdes specific environment variable
 # #
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/SPAdes-4.0.0/bin+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/spades-4.0.0/bin
 </sxh> </sxh>