Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a24_build:fastp_0240 [2024/11/21 13:02] – [Libraries additionnelles] foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a24_build:fastp_0240 [Date inconnue] (Version actuelle) – supprimée - modification externe (Date inconnue) 127.0.0.1
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-====== Installation de Fastp 0.24.0 ====== 
- 
-===== Libraries additionnelles ===== 
- 
-Les librairies suivantes sont nécessaires afin de compiler Fastp avec succès: 
-  * ''libdeflate-dev'' 
-  * ''libisal-dev'' 
- 
-<sxh bash> 
-% sudo apt install --no-install-recommends libdeflate-dev libisal-dev 
-</sxh> 
- 
-===== Procédure ===== 
- 
-  * Il faut aller chercher le code source sur GitHub: 
-<sxh bash> 
-% cd /opt/bio/sources 
-% sudo curl -L -o fastp.0.24.0.tar.gz https://github.com/OpenGene/fastp/archive/refs/tags/v0.24.0.tar.gz 
-% sudo tar -zxvf fastp.0.24.0.tar.gz 
-% sudo rm -rf fastp.0.24.0.tar.gz 
-</sxh> 
- 
-  * Il faut s'assurer que le répertoire ''fastp-0.24.0'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions: 
-<sxh bash> 
-% sudo chown -R root:root ./fastp-0.24.0 
-% sudo chmod 755 ./fastp-0.24.0 
-</sxh> 
- 
-  * On procède à la compilation grâce à la commande ''make''. 
-<sxh bash> 
-% cd fastp-0.24.0 
-% sudo make 
-</sxh> 
- 
-  * Pour accéder au programme, on modifie le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour y ajouter les lignes suivantes: 
-<sxh bash> 
-# 
-# Fast specific environment variables 
-# 
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/fastp-0.24.0 
-</sxh>