Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:pymol_250 [2025/05/11 08:49] – [Librairies additionnelles] foisys
+++ fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:pymol_250 [2025/05/15 16:08] (Version actuelle) – supprimée foisys
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-====== Installation de Pymol 2.5.0 ======
-===== Librairies additionnelles =====
-  * Les librairies suivantes sont nécessaires:
-  * ''python3-dev''
-  * ''libglew-dev''
-  * ''libpng-dev''
-  * ''libfreetype6-dev''
-  * ''libxml2-dev''
-  * ''libmsgpack-dev''
-  * ''python3-pyqt5.qtopengl''
-  * ''libglm-dev''
-  * ''libnetcdf-dev''
-<sxh bash>
-% sudo apt-get install python3-dev libglew-dev libpng-dev libfreetype6-dev libxml2-dev libmsgpack-dev python3-pyqt5.qtopengl libglm-dev libnetcdf-dev
-</sxh>
-===== Procédure =====
-Pour réussir à être à jour dans les versions de ce logiciel, l'approche code source a été choisie.
-  * Premièrement, obtenir la dernière version stable du code source à partir de GitHub:
-<sxh bash>
-% cd /opt/bio/sources
-% sudo curl -L -o pymol.v2.5.0.tar.gz https://github.com/schrodinger/pymol-open-source/archive/v2.5.0.tar.gz
-% sudo tar -zxvf pymol.v2.5.0.tar.gz
-% sudo rm -rf pymol.v2.5.0.tar.gz
-</sxh>
-  * Il faut que ''root'' soit le propriétaire de ce répertoire:
-<sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./pymol-open-source-2.5.0
-% sudo chmod 755 ./pymol-open-source-2.5.0
-</sxh>
-  * La compilation se fait via le script d'installation contenu dans le répertoire:
-<sxh bash>
-% cd ./pymol-open-source-2.5.0
-% sudo python3 ./setup.py build install \
---use-msgpackc=no \
---home=/opt/bio/sources/pymol-open-source-2.5.0
-</sxh>
-  * Il faut ajouter les lignes suivantes à la toute fin du fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour que le système trouve les applications:
-<sxh bash>
-#
-# PyMol specific environment variables
-#
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/pymol-open-source-2.5.0
-</sxh>
-  * Pymol est une application avec interface graphique; il faut donc l"utiliser dans l'interface Xfce ou bien via un client VNC/RDP ou un serveur XWindows. L'application s'appelle simplement:
-<sxh bash>
-% pymol
-</sxh>
-  * Il faut maintenant ajouter Pymol dans le menu Impilo:
-    * Plus à venir...