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fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:primer3_261 [2022/06/22 14:30] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:primer3_261 [2024/11/21 09:14] (Version actuelle) – supprimée foisys
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-====== Installation de Primer3 2.6.1 ====== 
- 
-===== Librairies additionnelles =====  
- 
-  * Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire. 
- 
-===== Procédure ===== 
- 
- 
-Voici la procédure suivi pour l'installation de Primer3 à partir du code source: 
- 
-  * Sous ''/opt/bio/sources'', on télécharge la toute dernière version du code source en utilisant sur GitHub: 
-<sxh bash> 
-% cd /opt/bio/sources 
-% sudo curl -L -o primer3.v2.6.1.tar.gz https://github.com/primer3-org/primer3/archive/v2.6.1.tar.gz 
-% sudo tar -zxvf primer3.v2.6.1.tar.gz 
-$ sudo rm -rf primer3.v2.6.1.tar.gz 
-</sxh> 
- 
-  * On se retrouve avec un répertoire appelé ''primer3-2.6.1''; il faut s'assure que le répertoire appartient à l'usager ''root'' et juste être certain de ses permissions:  
-<sxh bash> 
-% sudo chown -R root:root ./primer3-2.6.1 
-% sudo chmod -R 755 ./primer3-2.6.1 
-</sxh> 
- 
-  * Il faut alors se diriger vers ''./primer3-2.6.1/src'' et démarrer/tester la compilation; faut pas s'en faire, le tout prend quelques minutes. 
-<sxh bash> 
-% cd ./primer3-2.6.1/src 
-% sudo make && sudo make test 
-</sxh> 
- 
-  * Il n'y a pas de ''make install''  pour ce programme. Notez qu'il faut créer le lien symbolique ''primer32_core'' qui nécessaire pour que le programme ''eprimer32''  de la suite EMBOSS puisse le trouver et l'utiliser; il est incompatible avec l'appellation originale ''primer3_core''. 
- 
-<sxh bash> 
-% sudo ln -s /opt/bio/sources/primer3-2.6.1/src/primer3_core /opt/bio/sources/primer3-2.6.1/src/primer32_core 
-</sxh> 
- 
-   * Il faut maintenant modifier le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour que l'exécutable soit visible par tous: 
-<sxh bash> 
-# 
-# Primer3 specific environment variable 
-# 
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/primer3-2.6.1/src 
-</sxh>