Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:hmmer_332 [2021/10/31 16:33] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:hmmer_332 [2025/05/15 15:30] (Version actuelle) – supprimée foisys
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-====== Installation de HMMER 3.3.2 ====== 
- 
-===== Libraries ===== 
- 
-  * Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire  
- 
-===== Procédure ===== 
- 
-  * On va chercher l'archive: 
- 
-<sxh bash>  
-% cd /opt/bio/sources  
-% sudo curl -L -O http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer.tar.gz  
-% sudo tar -zxvf hmmer.tar.gz  
-% sudo rm -rf hmmer.tar.gz 
-</sxh> 
- 
-  * Il faut s'assurer que le répertoire ''hmmer-3.3.2''  appartient à ''root''  avec les bonnes permissions: 
- 
-<sxh bash>  
-% sudo chown -R root:root ./hmmer-3.3.2  
-% sudo chmod 755 ./hmmer-3.3.2 </sxh> 
- 
-  * On compile HMMER avec la valse habituelle: 
- 
-<sxh bash>  
-% cd hmmer-3.3.2 
-% sudo ./configure –prefix=`pwd`  
-% cd easel && sudo make install  
-% cd ../ && sudo make  
-% sudo make check  
-% sudo make install </sxh> 
- 
-  * On termine en modifiant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications: 
- 
-<sxh bash>  
- 
-# HMMER specific environment variables  
- 
-export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/hmmer-3.3.2/bin </sxh>