Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:hmmer_24i [2022/06/30 10:52] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:22_04_a23_build:hmmer_24i [2025/05/15 15:27] (Version actuelle) – supprimée foisys
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-====== Installation de HMMER 2.4i ====== 
- 
-===== Libraries ===== 
- 
-  * Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire  
- 
-===== Procédure ===== 
- 
-  * On va chercher l'archive: 
- 
-<sxh bash>  
-% cd /opt/bio/sources  
-% sudo curl -L -o hmmer-2.4i.tar.gz http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer-2.4i.tar.gz  
-% sudo tar -zxvf hmmer-2.4i.tar.gz  
-% sudo rm -rf hmmer-2.4i.tar.gz 
-</sxh> 
- 
-  * Il faut s'assurer que le répertoire ''hmmer-2.4i''  appartient à ''root''  avec les bonnes permissions: 
- 
-<sxh bash>  
-% sudo chown -R root:root ./hmmer-2.4i  
-% sudo chmod 755 ./hmmer-2.4i  
-</sxh> 
- 
-  * Si vous êtes sur la plateforme Raspberry Pi, il faut faire les commandes suivantes avant de procéder en mettant à jour deux fichiers pour que la commande ./configure puisse fonctionner: 
- 
-<sxh bash>  
-% cd ./hmmer-2.4i 
-% sudo curl -L -o config.guess "http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.guess;hb=HEAD" 
-% sudo curl -L -o config.sub "http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.sub;hb=HEAD" 
-</sxh> 
- 
-  * On compile HMMER avec la valse habituelle: 
- 
-<sxh bash>  
-% sudo ./configure –prefix=`pwd`  
-% sudo make  
-% sudo make check  
-% sudo make install  
-</sxh> 
- 
-  * On termine en modifiant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications: 
- 
-<sxh bash>  
-#  
-# HMMER specific environment variables  
-#  
-export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/hmmer-2.4i/bin  
-</sxh>