Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentesRévision précédente | |||
| fr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:index_creation_main [2026/02/19 07:35] – [Création des index : usage de scripts pour SLURM] foisys | fr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:index_creation_main [2026/02/19 13:35] (Version actuelle) – [Création des index : usage de scripts pour SLURM] foisys | ||
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| Ligne 70: | Ligne 70: | ||
| % gunzip snp151Common.txt.gz | % gunzip snp151Common.txt.gz | ||
| # Ici, le script est un peu plus exigeant... Ça prend plus de temps que les étapes précédentes mais ça se fait sur un RPi. | # Ici, le script est un peu plus exigeant... Ça prend plus de temps que les étapes précédentes mais ça se fait sur un RPi. | ||
| - | # A la fin, vous avez un deux fichiers: un avec .haplotype et un autre .snp avec gencode_r49_snp_haplo comme préfixe. | + | # A la fin, vous avez un deux fichiers: un avec .haplotype et un autre .snp en suffixe |
| % hisat2_extract_snps_haplotypes_UCSC.py / | % hisat2_extract_snps_haplotypes_UCSC.py / | ||
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